Совет возглавляет Председатель, избираемый из состава его членов на основе ежегодной ротации и поочередного представительства всех договаривающихся государств. В настоящее время Председателем является Тян Валерий Николаевич - Начальник Госавианадзора Республики Узбекистан.
В Совет входят первые руководители гражданской авиации и авиационной промышленности, а также командующие ВВС и ПВО государств - участников Соглашения.
Совет собственных штатов не имеет и самостоятельного финансирования не требует. Деятельность Совета обеспечивается МАКом.