Главами правительств Республики Армения, Республики Беларусь, Республики Казахстан, Кыргызской Республики, Российской Федерации, Республики Таджикистан, Туркменистана, Республики Узбекистан и Украины 26 июня 1992 года подписано Соглашение о сотрудничестве в области охраны здоровья населения, в соответствии с которым создан Совет по сотрудничеству в области здравоохранения Содружества Независимых Государств.
Членами Совета являются министры здравоохранения и главные государственные санитарные врачи государств – участников СНГ.
Азербайджанская Республика и Республика Молдова, не являясь участницами данного Соглашения, принимают активное участие в деятельности Совета и его рабочих органов.
Функции рабочего аппарата Совета выполняет Исполнительный комитет СНГ.
Проведено 18 заседаний. Последнее заседание состоялось в городе Минске 14 - 15 марта 2007 года.
Для подготовки проектов документов при Совете функционируют на постоянной основе 12 рабочих органов, которые подготовили и рекомендовали к практическому применению более 200 документов по проблемам охраны здоровья и обеспечения санитарно-гигиенического благополучия населения в государствах – участниках СНГ. Большинство из них востребовано и используется в практической деятельности министерств и ведомств здравоохранения государств - участников СНГ.
По инициативе Совета высшими органами Содружества Независимых Государств принято 14 межгосударственных соглашений и решений по вопросам сотрудничества в области здравоохранения (см. нормативно-правовая база).
Совет поддерживает отношения с Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ), Объединенной программой ООН по ВИЧ/СПИД (ЮНЭЙДС), Всемирной ассамблеей здравоохранения, ЮНИСЕФ (детский Фонд Организации Объединенных Наций).